Скачиваете в любую другую территорию (специально созданную папку, желательно на том же логическом диске, чтобы перебросилось потом быстро) только новые файлы (
Новые архивы, MyHomeLib и файлы inpx). Затем вручную переносите всё это в папку с раздачей (с заменой, где требуется). Удаляете у себя торрент-файл из клиента.
Скачиваете опять торрент-файл, запускаете его в обновленную раздачу, при этом в торрент-клиенте в окошке -
Не проверять хэш ставите галочку. Всё. Вы на раздаче, в сидах. Время занимает только скачивание нового архива.
По другим сборкам библиотек - то же самое.
Так держать, а то без полной библиотеки как то неуютно привык уже к ней одни FB2 не тема.