Печататься начал с 1972. Автор нескольких книг прозы, которые были изданы в Москве и Новосибирске. Уже его первое произведение «В том краю» (1972) выделялось своеобразием среди деревенской прозы тех лет и завоевало признание: «Крепкий чистый голос» (В. Лакшин).
Поселился в Томске в 1974 года.
Награждён премиями журналов: «Юность», «Крокодил», «Сельская молодежь».
С 1976 — член Союза писателей СССР.
В советское время книги В.Е. Афонина издавались в Болгарии, Венгрии, Западной Германии, затем в Прибалтике и др. странах.
В постсоветское время занимал принципиальную гражданскую позицию, что стало основанием для весьма прохладного к нему отношения со стороны областной бюрократии. Василий Афонин явно был не придворный писатель.
Автор книг: «В том краю» (1975); «Последняя осень» (1976); «Клюква ягода» (1979); «Игра в лапту» (1981); «Письма из Юрги» (1984); «Вечера» (1984); «Таксист» (1985); «Чистые плесы» (М., 1986); «Сполохи» (Томск, 989); «Биография» (1990), «В церковных перезвонах» (Ставрополь, 1991); «Диалектика природы» (М., 1991); «Поленница» (Томск, 1995); «Пока текут реки. (Хроника сибирской жизни)» (Томск, 1998); «Однажды навсегда» (М., 1999); «Дом на холме» (Т., 2001), «Дымы отечества». (Томск, Красное знамя, 2008); «Прощенное воскресенье». (Томск, Красное знамя, 2009). Печатает свои произведения в журналах «Знамя», «Сибирские огни», «День и ночь». Публиковался в сборнике «Сибирский рассказ. Новосибирск» (1986).
Василий Егорович Афонин умер в Томске 8 декабря 2021 года. Скромные похороны писателя состоялись 12 декабря.
